杜仲SQS基因的特征信息分析

• 作者: 宋莉 张天缘 杨仕梅 赵德刚 雷跃
• 来源期刊: 山地农业生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 杜仲鲨烯合酶基因 萜类化合物 生物信息学 基因结构 功能预测
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3223字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2019.06.001

摘要

鲨烯合酶(SQS)是催化植物细胞合成甾醇和三萜类化合物的一种关键酶.为探明杜仲SQS基因家族成员的存在及其特性,本文通过生物信息学分析方法,对杜仲SQS基因(EuSQS)进行发掘,并对其进化关系、基因结构、保守基序、染色体定位、蛋白理化性质、空间结构、调控元件等进行分析.从杜仲基因组数据中获得3条EuSQS基因,它们分布于不同的scaffold上,有5～6个外显子;EuSQS蛋白含396～440 aa,相对分子质量为45.73～49.06 kDa,均属于不稳定蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;EuSQS1和EuSQS3在结构上较为接近,二者与EuSQS2差异较大;除含有基本元件外,EuSQSs的顺式作用元件还包括光照和激素响应、分生组织表达、逆境胁迫及类黄酮生物合成等六类;在进化关系上,杜仲EuSQSs与产胶植物橡胶草及橡胶树的亲缘关系较近.分析结果为进一步对EuSQS基因的功能鉴定和利用提供了依据.