基于CAPS标记的甜瓜单果重相关性状QTL分析

• 作者: 刘柳 刘相玉 刘识 张裕舒 王学征 王迪 高鹏
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 甜瓜 单果重 遗传连锁图谱 QTL
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1601-1613
• 页数: 13页
• 字数: 8521字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2019.09.011

摘要

[目的]基于甜瓜全基因组重测序技术,挖掘SNP位点并开发CAPS标记,构建遗传连锁图谱.初步为甜瓜单果重相关性状进行QTL定位,为甜瓜单果重相关基因挖掘奠定理论基础.[方法]选取栽培甜瓜品系M4-130为母本,野生甜瓜品系X207为父本,构建F2∶3群体材料.对甜瓜果实单果重、果实长宽、果肉厚度、果形指数及可溶性固形物含量等性状进行相关性分析.对亲本材料进行20×深度重测序,利用BWA、SAMToo1s、VCFToo1s等软件在全基因组范围内挖掘双亲SNP位点,利用SNP2CAPS软件结合甜瓜基因组上的限制性内切酶酶切位点开发CAPS标记,建立遗传连锁图谱.最后采用复合区间作图法对甜瓜果实单果重、果实长宽、果肉厚度、果形指数及可溶性固形物含量进行QTL分析.[结果]单果重与果实长度、果实宽度及果肉厚度呈显著相关.开发得到可利用CAPS标记1 85个,构建一张包含1 2个连锁群的遗传连锁图谱,覆盖总长度为1 600.45 cM,标记间的平均遗传距离8.65 cM.定位发现与单果重相关QTL位点7个(FW3.1、FW4.1、FW5.1、FW6.1、FW8.1、FW8.2、FW11.1),与果实长度相关QTL位点7个(FL2.1、FL3.1、FL4.1、FL5.1、FL6.1、FL8.1、FL11.1),与果实宽度相关QTL位点5个(FWID3.1、FWID4.1、FWID8.1、FWID10.1、FWID11.1),与果肉厚度相关QTL位点2个(FT6.1、FT11.1),与果形指数相关QTL位点1个(FS2.1),与可溶性固形含量相关QTL位点2个(SS6.1、SS12.1).[结论]获得了24个QTL位点.确定了一个主效QTL位点FW8.1,贡献率高达25.8774％,LOD值为16.8746.发现单果重与果实长度、果实宽度及果肉厚度密切相关,定位区间相同或相邻,紧密集中在3、4、5、6、8、11染色体上.