基于高通量测序的营养不良儿童肠道菌群多样性研究

• 作者: 吴薇岚 江蕙芸
• 来源期刊: 发育医学电子杂志
• 关键词: 营养不良儿童 高通量测序 硬壁菌门 多形杆状菌 罗斯菌
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 188-195
• 页数: 8页
• 字数: 5044字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-5340.2019.03.006

摘要

目的 采用高通量测序方法,比较营养不良儿童与正常儿童肠道菌群物种多样性及组成特点的差异.方法 2017年1月至6月,在广西壮族自治区妇幼保健院儿童营养门诊就诊的营养不良患儿中,纳入20例为研究对象;同时纳入正常健康儿童20例为对照组.采集粪便样本,提取细菌DNA,通过两步PCR的方法构建文库,扩增16S rDNA中V4-V5区进行高通量测序.进行生物信息学分析,构建稀释性曲线;采用mothur软件对Alpha多样性进行计算.利用R语言进行Heatmap分析、主成分分析PCA(Principal Component Analysis)、典型关联分析CCA(Canonical Correlation Analysis)/冗余分析RDA(Redundancy Analysis),分别在样本的门和属两个分类水平上进行数据整合归类比较统计.结果 营养不良组与对照组儿童的月龄、性别、分娩方式、出生胎龄以及喂养等基本情况比较,差异均无统计学意义.两组儿童肠道菌群的丰富度和均匀度比较,差异无统计学意义.两组儿童肠道菌群门水平微生物共检出14种,营养不良组的硬壁菌门(Firmicutes)及未分类菌的OUT数低于对照组,拟杆菌(Bacteroidetes)的OUT数高于对照组(P<0.05).两组儿童肠道菌群属水平微生物共检出154种,其中多形杆状菌(Bacteroides)、乳酸菌(Lactobacillus)、罗斯菌(Roseburia)等24个属的OTU在两组间差异具有统计学意义(P<0.05),其中营养不良组的多型杆状菌(Bacteroides)和罗斯菌(Roseburia)的OUT数高于对照组,乳酸菌(Lactobacillus)的OUT数低于对照组.将两组样本进行主成分PCA分析,根据样本聚类情况,营养不良组与对照组虽然距离相近,但仍可看出两组分别聚集.结论 营养不良儿童肠道菌群在门水平中硬壁菌偏低,在属水平中多形杆状菌及罗斯菌含量偏高,因此可根据不同菌属的作用特点来调整菌群,以期达到菌群平衡、吸收良好、体格发育正常的良性循环.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江蕙芸	广西壮族自治区妇幼保健院儿童保健科	42	221	9.0	13.0
2	吴薇岚	广西壮族自治区妇幼保健院儿童保健科	6	7	1.0	2.0