基于SNaPShot-FCA的乙醛脱氢酶2基因型微量检测

• 作者: 冯传芮 吴晓婷 张又 曾树树 李永生 罗亚雄 高秀峰
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 关键词: 乙醛脱氢酶2 rs671位点 SNaPShot技术 荧光毛细分析法
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 737-742
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

目的 建立单碱基末端延伸-荧光毛细分析法(SNaPShot-fluorescence capillary analysis,SNaPShot-FCA)快速检测乙醛脱氢酶2基因(ALDH2) rs671位点的基因型.方法 收集人外周血细胞,提取基因组DNA;采用R6G-ddATP和cy5-ddGTP作为荧光底物,用SNaPShot法扩增ALDH2基因,生成3'末端带有不同荧光标记的DNA产物;琼脂糖凝胶电泳分离并回收产物,用FCA微量检测,根据荧光光谱鉴定ALDH2 rs671的基因型;样本检测均重复3次,并与DNA测序结果相比较.结果 优选的R6G-ddATP和cy5-ddGTP浓度分别为1.4 μmol/L和8.0μmol/L;在最适条件下运用SNaPShot-FCA对106例样本进行了ALDH2基因型检测,检测结果显示:野生型(GG)67例,杂合型(AG)38例,突变纯合型(AA)1例,与测序结果一致.结论 成功建立了微量检测ALDH2基因型的SNaPShot-FCA,可用于ALDH2基因的快速筛查与鉴定.