不同光周期和温度处理下桂花内参基因的筛选

• 作者: 付建新 王千千 董彬 蒋琦妮 赵宏波
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 桂花 内参基因 qRT-PCR GI基因
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 928-934
• 页数: 7页
• 分类号: S685.13
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.05.011

摘要

光周期和温度处理能够影响桂花Osmanthus fragrans的基因表达水平和花芽分化过程,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析基因表达已成为研究这些过程机制的重要手段,而筛选出适合光周期和温度处理的内参基因在研究桂花分子机制中尤为重要.为了得到不同光周期和温度处理下桂花中稳定的内参基因,以桂花品种'佛顶珠'O.fragrans'Foding Zhu'当年生枝条的第2或第3对幼叶为材料,以OfACT,OfEF1α,OfIDH,OfRAN1,OfTUB,OfUBC2和Of18S等7个基因作为候选内参基因,利用geNorm,NormFinder和BestKeeper 3个软件对候选内参基因的表达稳定性进行比较分析;以昼夜节律相关基因GIGANTEA(GI)对筛选出的最佳内参基因进行验证.结果表明:在不同处理条件下,桂花叶片中OfRAN1和OfIDH为最佳内参基因,Of18S的稳定性最差(geNorm分析结果显示OfRAN1和OfIDH的稳定值为0.347,而Of18S的稳定值为0.601;NormFinder显示OfRAN1和OfIDH的稳定值为0.135和0.206,而Of18S为0.474;BestKeeper显示OfRAN1的稳定值为0.80,OfIDH为0.133,而Of18S为0.474);GI基因的相对表达水平分析表明(昼夜节律基因GI的表达模式为在白天累积并在夜间下降),在7个内参基因及OfRAN1和OfIDH的基因组合中,使用OfRAN1和OfIDH的内参基因组合可获得GI基因更为精确的基因表达结果.综上所述,OfRAN1和OfIDH内参基因组合是桂花在不同光周期和温度处理下最佳内参基因组合.这为桂花分子机制研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董彬	浙江农林大学风景园林与建筑学院	13	23	3.0	3.0
2	赵宏波	浙江农林大学风景园林与建筑学院	30	133	7.0	10.0
3	付建新	浙江农林大学风景园林与建筑学院	18	63	4.0	6.0
4	蒋琦妮	浙江农林大学风景园林与建筑学院	2	3	1.0	1.0
5	王千千	浙江农林大学风景园林与建筑学院	2	4	2.0	2.0