东方泽泻实时荧光定量PCR内参基因的筛选及AoSS基因的组织表达特性分析

• 作者: 刘琪 刘青芝 吴启南 孙云飞 巢建国 桑晓华 王小浩 谷巍
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 东方泽泻 内参基因 鲨烯合酶(SS) 实时荧光定量PCR(qRT-PCR) 表达特性
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1467-1475
• 页数: 9页
• 分类号: S567.239
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.08.01

摘要

[目的]筛选适用于东方泽泻实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的内参基因,并分析其鲨烯合酶基因(AoSS)的表达特性,为后续研究东方泽泻原萜烷型三萜生物合成调控及诱导机制打下基础.[方法]从东方泽泻转录组中选取内参基因18S rRNA、EF1α、GAPDH、ACT、UBQ和UBC,应用qRT-PCR检测其在不同组织和激素处理下的表达情况,并借助Delta CT、GeNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其表达稳定性进行分析评价.以筛选到的内参基因分析AoSS基因在不同组织中的表达情况.[结果]18S rRNA、GAPDH和EF1α基因在东方泽泻不同组织的表达稳定性较高,但18S rRNA、UBC和EF1α基因在不同激素处理下的表达稳定性均较高.以18S rRNA、GAPDH和EF1α基因为内参分析AoSS基因在东方泽泻不同组织中的表达量情况,结果显示,AoSS基因在东方泽泻不同组织中均有表达,其表达情况基本一致,均在东方泽泻块茎中表达量最高,其次是叶柄和叶,而在根中表达量最低.[结论]18S rRNA、GAPDH和EF1α基因是研究东方泽泻不同组织中基因表达分析的首选内参基因;18S rRNA、EF1α和UBC基因是研究激素处理下基因表达的首选内参基因.AoSS基因的表达具有组织特异性,其可能在东方泽泻的生长发育中发挥重要的调控功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴启南	南京中医药大学药学院	151	1620	21.0	32.0
2	谷巍	南京中医药大学药学院	107	592	13.0	17.0
3	巢建国	南京中医药大学药学院	97	659	13.0	20.0
4	刘青芝	南京中医药大学药学院	6	27	2.0	5.0
5	桑晓华	南京中医药大学药学院	8	30	3.0	5.0
6	王小浩	南京中医药大学药学院	6	10	2.0	2.0
7	刘琪	南京中医药大学药学院	7	15	2.0	3.0
8	孙云飞		6	15	2.0	3.0