PARP1调控黑素瘤细胞中lncRNA表达谱的分析

• 作者: 孙靓 张键 梁艳 牟宽厚 王丽娟 田琼 穆欣 葛睿 高田原
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 黑素瘤 聚二磷酸腺苷核糖多聚酶1 长链非编码RNA BANCR 长链非编码RNA芯片
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 36-40,45
• 页数: 6页
• 分类号: R75
• 字数: 2846字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2019.08.009

摘要

目的 通过lncRNA芯片分析黑素瘤A2058细胞系中由PARP1调控的lncRNA.方法 在黑素瘤A2058细胞系中利用小干扰RNA干涉PARP1表达水平,利用Western blot法及RT-PCR检测PARP1的干涉效率.提取PARP1干涉片段及对照片段转染细胞的总RNA进行lncRNA芯片检测.RT-PCR对部分差异性lncRNA进行验证.在PARP1干涉组及对照组中利用RT-PCR检测黑素瘤相关lncRNA的表达水平.结果 Western blot法及RT-PCR法证实在黑素瘤A2058细胞系中PARP1表达水平可被小干扰RNA片段显著抑制,证实样本可用于下一步实验.lncRNA芯片结果显示干涉PARP1表达可引起55个lncRNA表达上调,68个lncRNA表达下调.通过RT-PCR对部分差异性表达lncRNA进行验证,结果表明与芯片筛选结果一致.RT-PCR证实干涉PARP1可抑制黑素瘤相关lncRNA BANCR的表达水平.结论 PARP1可能通过促进BANCR及调控其他lncRNA的表达从而介导黑素瘤的恶性转化.