玫烟色棒束孢基因组候选效应因子的预测分析

• 作者: 罗梅 舒永馨 董章勇 陈欣瑜
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玫烟色棒束孢 效应因子 全基因组 分析
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 页码范围: 2078-2083
• 页数: 6页
• 分类号: S641.1
• 字数: 4980字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2019.12.021

摘要

在玫烟色棒束孢(Isaria fumosorosea)全基因组10 061个蛋白质序列的基础上,经过SignalP v4.1分析得到1 112个具有信号肽的蛋白序列;以此为基础用TMHMM v2.0分析得到1 030个跨膜数小于2的蛋白序列;1 030个具有信号肽的蛋白经过TargetP v 1.1分析得到1 001个定位为S的蛋白序列;最后经过ProtComp v 9.0分析,得到929个蛋白质定位于细胞质中的分泌蛋白序列.929个蛋白中包含半胱氨酸含量大于等于6的蛋白序列共495个,其中146个蛋白序列的串联重复序列大于或等于9.共137个蛋白在病原物—寄主互作数据库(Pathogen-host interaction database,PHI)中获得注释,其中91个蛋白为候选效应蛋白.挑取小于300个氨基酸的蛋白序列,共筛选到19个候选效应因子.最终从10 061个蛋白序列中筛选得到19个候选致病效应因子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗梅	仲恺农业工程学院农业与生物学院	32	136	7.0	11.0
2	董章勇	仲恺农业工程学院农业与生物学院	26	115	7.0	10.0
3	陈欣瑜	仲恺农业工程学院农业与生物学院	4	3	1.0	1.0
4	舒永馨	仲恺农业工程学院农业与生物学院	4	3	1.0	1.0