长白落叶松过氧化氢酶LoCAT1基因克隆及表达分析

• 作者: 宋跃 张含国 李淑娟 杨宇宁 白晓明 董实伟
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 长白落叶松 LoCAT1 克隆 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 539-546
• 页数: 8页
• 分类号: Q781|S791.22
• 字数: 4801字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2019.04.008

摘要

为了解长白落叶松过氧化氢酶(CAT)基因的相关信息,探究该基因在长白落叶松不同组织中及不同逆境胁迫下的表达特性,本研究根据长白落叶松转录组数据库中获得的CAT1基因全长序列设计引物,克隆得到长白落叶松CAT1基因,命名为LoCAT1.该基因完整的开放阅读框(ORF)长度为954 bp,共编码317个氨基酸.系统进化树分析结果显示,LoCAT1基因与北美云杉、银杏等CAT基因亲缘关系较近.利用实时定量RT-PCR技术分析了LoCAT1基因在长白落叶松中的组织表达特异性和应对非生物胁迫的表达模式.结果 表明:LoCA T1基因在长白落叶松的根、茎、叶中均有表达,其中存茎部表达量最低,在叶中相对表达量最高.在非生物胁迫下,LoCAT1基因在长白落叶松根、茎、叶中的表达均发生了变化,但表达模式不同.在NaCl处理后,根和茎中LoCA T1基因均表现为下调表达,在12h时表达量最低,而叶中LoCAT1基因表达在24 h明显受抑制,随后被上调表达,胁迫96 h时表达量最高.PEG6000处理后,根和茎中LoCAT1基因的表达在胁迫早期被明显抑制,随后被上调表达.而叶中LoCAT1基因的表达在所有时间点均表现为上调表达.本研究推测长白落叶松LoCA T1基因可能参与了植物响应逆境胁迫的应答.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李淑娟		24	362	11.0	19.0
2	张含国		60	572	13.0	21.0
3	宋跃		2	5	1.0	2.0
4	白晓明		2	5	1.0	2.0
5	董实伟		2	1	1.0	1.0
6	杨宇宁		2	1	1.0	1.0