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广东地区犬瘟热病毒血凝素基因的克隆与序列分析
广东地区犬瘟热病毒血凝素基因的克隆与序列分析
作者:
刘若寒
周沛
李守军
林希
郑清栩
郝香琪
陶攀
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
犬瘟热病毒
犬瘟热
血凝素基因
序列分析
变异
摘要:
[目的]对广州和东莞市宠物犬感染犬瘟热病毒(CDV)的情况进行病原鉴定和分析,为监测CDV的遗传变异情况和防治犬瘟热(CD)提供数据基础.[方法]从表现CD症状的犬只中鉴定了17份CDV阳性样本,采用RT-PCR的方法克隆得到这些野毒株的血凝素(H)基因序列,采用生物信息学方法进行序列比对分析.[结果]17株CDV的H基因核苷酸与氨基酸序列的相似性分别为97.4%~100.0% 和97.5%~100.0%,与Onderstepoort、Lederle和Convac等疫苗株相比,其核苷酸与氨基酸序列相似性分别为90.3%~91.5% 和89.4%~90.8%.进化树分析结果显示,17株CDV野毒株均属于AsiaⅠ型,与疫苗株的分支较远;本研究鉴定的野毒株已进化形成9个潜在的N?糖基化位点.[结论]AsiaⅠ型CDV仍为该地区的流行基因型,基因型较稳定,但与疫苗株相比形成了一定的进化距离和出现了大量的变异.因此,继续监控CDV在犬群中的进化,掌握其遗传变异状况具有重要意义.
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文献信息
篇名
广东地区犬瘟热病毒血凝素基因的克隆与序列分析
来源期刊
华南农业大学学报
学科
农学
关键词
犬瘟热病毒
犬瘟热
血凝素基因
序列分析
变异
年,卷(期)
2019,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
22-28
页数
7页
分类号
S852.65
字数
3598字
语种
中文
DOI
10.7671/j.issn.1001-411X.201812044
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序列分析
变异
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
华南农业大学学报
主办单位:
华南农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-411X
CN:
44-1110/S
开本:
大16开
出版地:
广州五山华南农业大学学报编辑部
邮发代号:
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
2705
总下载数(次)
5
总被引数(次)
47288
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