13个苹果NAC转录因子基因的克隆与表达分析

• 作者: 冉昆 李慧峰 董庆龙 赵强
• 来源期刊: 植物遗传资源学报
• 关键词: 苹果 NAC转录因子 基因克隆 序列分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1041-1051
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20181205001

摘要

利用同源比对和RT-PCR技术,从紫弘富士苹果(Malus domestica(Suckow) Borkh.‘Zihong Fuji’)中克隆了13个NAC转录因子基因:MdNA C40～45,MdNAC47～53(GenBank登录号为MG099877～MG099882,MG099884～MG099890).序列分析表明,其开放阅读框(ORF,open reading frame)分别为1470bp、1065 bp、912 bp、885 bp、948 bp、1041 bp、1182 bp、639 bp、705 bp、1830bp、1980 bp、747bp和1137bp.进化分析表明,MdNAC41属于AtNAC3组,MdNAC40、MdNAC42～43和MdNAC45～53属于NAM组,MdNAC44属于VND组.亚细胞定位预测结果显示,MdNAC40～45、MdNAC47～50和MdNAC52～53可能定位于细胞核中;MdNAC51可能定位在细胞质或细胞核中.Array结果显示,13个MdNAC基因在16个被检测组织中均有不同程度的相对表达水平.RNA-seq结果显示,MdNAC43、MdNAC45、MdNAC47、MdNAC49和MdNA C51的表达明显受斑点落叶病菌(AAAP,Alternaria alternata apple pathotype)侵染的诱导.实时荧光定量PCR分析表明,在150 mmol/L NaCl处理下,嘎啦组培苗中MdNAC45、MdNAC47和MdNAC52的转录水平受到诱导,而MdNAC40、Md NA C48和MdNA C51的转录水平下调;在300 mmol/L甘露醇处理下,MdNAC50转录水平受到诱导,Md NA C41转录水平下调.这表明MdNAC基因多呈组成型表达,并受斑点落叶病菌(AAAP)、NaCl和甘露醇诱导或下调,可能参与调控苹果生长发育和逆境胁迫等过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李慧峰		76	332	10.0	15.0
2	冉昆		49	116	5.0	9.0
3	赵强	山东农业大学园艺科学与工程学院	6	87	4.0	6.0