MITE转座子在不同甘蓝型油菜品种中的多态性研究

• 作者: 侯锦娜 安素妨 李保全 李高原 鲁丹丹
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 微型反向重复转座因子(MITE) 甘蓝型油菜 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1389-1399
• 页数: 11页
• 分类号: Q346+.5|Q789|S565.4
• 字数: 5344字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2019.08.1389

摘要

微型反向重复转座因子(MITE)在真核生物基因组中普遍存在,其活动能够在物种内形成丰富的多态性,在基因组进化和基因调控中均发挥重要作用.该研究利用286对不同M IT E家族侧翼序列筛选的特异引物,对101个中国油菜、27个加拿大油菜和29个合成油菜品系(共157个品系)的基因组DNA进行多态性研究,以明确M IT E家族的插入/缺失多态性以及在不同油菜品种之间插入的遗传多样性,进而探讨他们之间的亲缘关系.结果显示:(1)286对引物中筛选出60对条带清晰重复性高的多态性引物,多态性比例21.0％;其中Stowaway-like家族和Tourist-like家族特异引物的多态性比例分别为24.6％ 和20.0％.(2)PCR扩增结果显示,60对多态性引物对中国、加拿大、合成油菜品系的基因组DNA分别扩增出4029、1044、1087条清晰可辨的条带.(3)UPGMA聚类显示,中国油菜品种间遗传相似系数在0.59～0.95,加拿大油菜品种间遗传相似系数在0.73～0.95;合成油菜品种间遗传相似系数值在0.64～0.93.研究表明,M I T E在基因组中大量随机插入,形成种内丰富的多态性,利用M IT E家族引物检测不同地区的油菜种质资源的多态性,可为油菜的育种找到许多尚未被开发的遗传变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李保全	河南省农业科学院作物设计中心	20	49	4.0	5.0
2	安素妨	河南省农业科学院作物设计中心	7	7	2.0	2.0
3	侯锦娜	河南省农业科学院作物设计中心	6	4	1.0	1.0
4	鲁丹丹	河南省农业科学院作物设计中心	6	7	2.0	2.0
5	李高原	华中农业大学信息学院	1	0	0.0	0.0