基于辐射防护基因集的抗辐射损伤先导化合物预测

• 作者: 伯晓晨 刘祯 杨晓曦 王乃震
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 先导化合物 辐射防护剂 基因表达谱 转录组数据 LINCS计划
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 252-259
• 页数: 8页
• 分类号: R979.6
• 字数: 5153字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2019.04.004

摘要

目的 利用基于网络的细胞反应印记整合文库(LINCS)计划的小分子化合物刺激不同细胞系的转录谱数据,构建算法评估化合物的抗辐射损伤活性,发现抗辐射损伤先导化合物.方法 基于基因本体(gene ontology,GO)数据库构建辐射防护基因集,并基于基因集富集分析算法构建算法评估化合物的抗辐射损伤潜能,预测具有抗辐射损伤活性的先导化合物.结果 建立了4个具有抗辐射损伤效果的辐射防护基因集,以及利用转录组数据预测抗辐射损伤先导化合物的方法;在32 560个小分子化合物中预测获得了299个抗辐射损伤先导化合物,其中17个已被报道具有抗辐射损伤活性.结论 预测结果具有较好参考价值;预测方法速度快,成本低,可有效发现具有抗辐射损伤活性的化合物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	伯晓晨	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	8	7	1.0	2.0
2	刘祯	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	3	2	1.0	1.0
6	杨晓曦	军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所	1	0	0.0	0.0
7	王乃震		1	0	0.0	0.0