山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的转录组分析

• 作者: 主性 刘茂军 孙敏 嵇辛勤 张纹纹 李基棕 李文良 杨蕾蕾 毛立 肖芳 郝飞 钟纯燕
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 山羊副流感病毒3型 MDBK细胞 高通量测序 转录组
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 364-372
• 页数: 9页
• 分类号: S852.659.5
• 字数: 5140字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.02.014

摘要

本研究旨在探究山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞后的转录组基因变化情况,丰富CPIV3转录组信息.取1 MOI CPIV3 JSHA2014-1病毒液感染MDBK细胞,设非感染正常细胞为对照,于24 h后收获细胞,提取总RNA,利用Illumina HiSeqTM 2500对感染组与对照组进行高通量测序,并用测序评估、基因注释等生物信息学方法进行分析.结果显示,差异表达基因共261个,其中表达上调140个,表达下调121个,经RT-qPCR方法验证8个差异表达的干扰素信号通路相关基因,结果与高通量测序一致.进一步GO分类结果显示,差异表达基因主要涉及细胞生物学进程、构成细胞的组分以及实现的分子功能三个方面,KEGG分析显示这些基因参与代谢、生物系统、细胞进程、基因信息进程和环境信息进程.本研究为深入探究CPIV3的致病机制奠定了基础.