云南省柯萨奇病毒B2型VP1区3'端序列的基因特征分析

• 作者: 付晓庆 向以斌 周晓芳 周永明 姜黎黎 寸建萍 徐闻 田炳均
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 柯萨奇病毒B2型 VP1基因 基因特征分析
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 492-498
• 页数: 7页
• 字数: 4443字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2019.07.002

摘要

目的 对云南省柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2,CV-B2)不同时间分离的15株病毒VP1区3'端编码序列基因特征进行分析.方法 对云南省2005—2006年从急性迟缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例、2013年从健康儿童和2014年从手足口病(hand,foot and mouth dis-ease,HFMD)病例中分离到的15株CV-B2的VP1区3'端进行基因扩增和测序;根据文献从GenBank下载CV-B2 VP1编码序列作为参考序列,用MEGA5.2软件计算不同毒株间的核苷酸(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)差异率,并构建系统进化树,进行VP1区3'端编码序列基因特征和分子流行病学分析.结果 2005年云南省从232例AFP病例中分离到1株CV-B2,2006年从240例AFP病例中分离到1株CV-B2,2013年从400名健康儿童中分离到12株CV-B2,2014年从500例HFMD病例中分离到1株CV-B2.对15株CV-B2基因特征分析表明,CV-B2可分为5个基因型.基因型1(gen-otype 1)由原型株(prototype)Ohio-1和1988年中国台湾分离株01-1组成;基因型2由2006、2007和2010年法国株组成;基因型3由云南株、山东株、河南株、福建株和中国台湾株组成;基因型4由俄罗斯分离株、云南2005及2006年AFP分离株和印度株组成;基因型5由中国台湾分离株、山东株和澳大利亚新南威尔士株组成.CV-B2的基因型分布具有地理多样性的特点.结论 云南省从健康儿童中分离的12株和从HFMD病例中分离到的1株CV-B2为基因型3,从AFP病例中分离到的2株CV-B2为基因型4.健康儿童分离株与HFMD分离株之间的nt差异率仅为0.76％,aa差异率仅为0.03％,它们具有同一进化来源.而健康儿童分离株、HFMD分离株(基因型3)与2005年、2006年两株AFP分离株(基因型4)的nt差异率为15.11％和15.25％,aa差异率为2.76％和2.72％.CV-B2与AFP和HFMD的致病关系值得深入研究.