猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析

• 作者: 伍和明 唐薇薇 易春华 朱春刚 秦长串 谢齐斌 韦达有
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 猪嵴病毒 VP1基因 序列测定 分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 670-673
• 页数: 4页
• 分类号: S852.659.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.04.670

摘要

[目的]对猪嵴病毒(PKV) VP1基因进行测序与同源性分析,确认其可能来源,为今后的生物学特性分析及仔猪腹泻防治工作提供科学依据.[方法]采用RT-PCR对GXPKV-1毒株VP1基因进行克隆,运用DNASTAR软件包中Megalign程序对测序获得的VP1基因进行核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性分析.[结果]GXPKV-1毒株ⅥP1基因全长762 bp,共编码254个氨基酸,与GenBank已公布的13株参考毒株VP1基因的核苷酸同源性为74.1％～85.4％,推导氨基酸同源性为81.1％～93.3％.根据VP1基因推导氨基酸序列进行系统发育进化分析,发现GXPKV-1毒株与Gansu-2012、JS1419等国内参考毒株同属于同一亚群,而与瑞士分离株Swine-S-1-2007、泰国分离株THA-2008、美国分离株H24-2012-USA及四川分离株CHN-SC-2011-02等的亲缘关系较远.[结论]猪嵴病毒GXPKV-1毒株起源于国内流行毒株的传播,在新的环境下虽然其VP1基因核苷酸发生变异,但由于同义翻译,推导氨基酸的同源性仍然较高,说明碱基突变并未引起蛋白结构的改变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	伍和明		5	8	2.0	2.0
2	易春华		8	3	1.0	1.0
3	韦达有		8	18	2.0	4.0
4	唐薇薇		5	9	2.0	2.0
5	谢齐斌		1	1	1.0	1.0
6	朱春刚		4	5	1.0	2.0