热胁迫下水仙花叶片的转录组分析

• 作者: 宋姣敏 徐小萍 赖钟雄 陈桂信 陈裕坤
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水仙 高温胁迫 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 热带植物基因组学与基因编辑专题
• 页码范围: 1991-2000
• 页数: 10页
• 分类号: S682.2+1
• 字数: 6326字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.011

摘要

为研究水仙响应高温胁迫过程中相关基因的表达及响应热应激的分子机制,本研究以漳州水仙花为材料,使用BGISEQ-500测序技术,对高温(30、35℃)处理及正常生长条件(15℃)的水仙叶片进行转录组学的测序分析.使用Trinity软件对15(对照)、30、35℃(高温胁迫)处理24 h的水仙叶片测序数据进行从头组装,利用BLAST软件进行基因比对注释,通过DEGseq和PossionDis检测差异表达基因,并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析.结果表明:本次水仙花叶片测序共获得112160条总长度为128733815 bp、平均长度为1147 bp的Unigene,其N50以及GC含量分别为1770 bp和42.33％.Nr比对注释匹配度最高的物种为石刁柏,利用KOG数据库进行比对,5560条Unigene序列分布于25个功能区域.差异表达基因GO富集显示与光合系统及膜系统相关的GO term被显著富集,KEGG分析显示次生代谢物的生物合成、苯丙烷类生物合成、代谢途径、光合作用、糖胺聚糖降解、乙醛酸和二羧酸代谢、光合作用?天线蛋白、单萜类生物合成等8条代谢途径在3个比较组中均显著性富集,硫胺素代谢途径是唯一在高温胁迫条件下均显著富集的代谢途径.本研究注释了大量相关基因序列,通过本研究为改善水仙花植物的耐热性及耐热性品种的培育提供了丰富的数据资源和分子基础.