基于水稻线粒体atp6基因的稻属CMS基因起源及DNA条形码的研究

• 作者: 刘雅婷 娄红波 张雪梅 李平 赵自仙
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 农学
• 关键词: atp6基因 水稻 序列分析 起源 DNA条形码
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传·育种
• 页码范围: 555-563
• 页数: 9页
• 分类号: S511.032
• 字数: 5756字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).201903033

摘要

[目的]探讨亚洲栽培稻CMS基因起源及水稻线粒体atp6特异性引物作为稻属DNA条形码标记的应用.[方法]用水稻atp6特异性引物通过PCR检测产于中国的4种水稻,共720个个体,并对111个个体测序.[结果]普通野生稻和亚洲栽培稻中均检测到atp6保守序列.药用野生稻中没检测到扩增产物.疣粒野生稻中检测到的5个单倍型间共计17个变异位点.澜沧、普洱、勐海居群共同拥有H1,单倍型H2、H3、H4和H5分别为新平、墨江、保亭和崖城居群特有.云南组和海南组,组内平均遗传距离为0,组间为0.02;组间遗传分化系数Fst为92.08％;变异位点数(S)、单倍型数(h)、核苷酸多样性(Pi)均显示:云南组(4、3、0.002 01)遗传多样性大于海南组(1、2、0.001 31);云南组单倍型多样性Hd为0.6,海南组为1.5个单倍型与水稻atp6保守序列的相似度最高为45.19％.最大似然法ML进化树显示:澜沧、普洱及勐海一带可能是疣粒野生稻的起源地,海南疣粒野生稻可能源自大陆.[结论]水稻atp6特异性引物可作为疣粒野生稻种内条形码标记,该标记也可区分普通野生稻、药用野生稻和疣粒野生稻.从线粒体DNA角度证实亚洲栽培稻CMS基因源自普通野生稻.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘雅婷	云南农业大学教务处	68	553	12.0	20.0
2	赵自仙	云南农业大学农学与生物技术学院	19	38	4.0	5.0
3	张雪梅	云南农业大学农学与生物技术学院	27	260	7.0	16.0
4	李平	云南农业大学农学与生物技术学院	3	3	1.0	1.0
5	娄红波	云南农业大学农学与生物技术学院	9	35	4.0	5.0