基于线粒体COⅠ基因的DNA条形码在沼虾属种类鉴定中的应用

• 作者: 郑小壮 郭国才 郭照良 陈文坚 陈清华
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 沼虾属 DNA条形码 COⅠ基因 鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 514-521
• 页数: 8页
• 分类号: S917.4
• 字数: 3766字
• 语种: 中文

摘要

为探索DNA条形码在沼虾属(Macrobrachium)种类鉴定中的可行性,对21种沼虾(亚洲群体7种和美洲群体14种)的COⅠ基因片段序列进行分析.结果显示:沼虾COⅠ基因组成偏倚明显,AT含量(57.74％)高于GC(42.26％),GC在各个密码子位点的含量由高到低分别为第1密码子位点(49.24％)、第2密码子位点(40.72％)、第3密码子位点(36.82％);基于Kimura 2-Parameter模型分析21种沼虾的种间和种内平均遗传距离分别为0.753和0.005,种间平均遗传距离是种内遗传距离的150.6倍,符合HEBERT所推荐的鉴定不同物种的最小有效种间遗传距离为0.02以及种间遗传距离大于或等于10倍种内遗传距离的标准;在分子系统发育树中,NJ树和ML树的拓扑结构基本一致,亚洲种群和美洲种群分别以100％和82％的置信度形成2个姐妹支,并且同种沼虾都以较高的置信度聚集在同一分支内.研究结果证明,线粒体COⅠ基因能有效地对沼虾属的种类进行鉴别.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭照良	佛山科学技术学院生命科学与工程学院	7	23	2.0	4.0
2	郑小壮	佛山科学技术学院生命科学与工程学院	2	0	0.0	0.0
3	陈文坚	佛山科学技术学院生命科学与工程学院	3	1	1.0	1.0
7	郭国才	佛山科学技术学院生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
8	陈清华		3	0	0.0	0.0