杜梨NHX基因家族的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

• 作者: 常有宏 张绍铃 李慧 杨青松 王影 蔺经
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杜梨 NHX基因家族 非生物胁迫 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 825-836
• 页数: 12页
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20180347

摘要

[目的]NHX基因亚家族为钠氢逆转运体,具有Na+/H+ exchange(PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种物种中,主要参与植物响应盐胁迫过程离子平衡的重建.分析鉴定杜梨中NHX基因及其耐盐机制有助于实际生产中更为有效地利用这一砧木资源.[方法]结合己公布的梨基因组数据以及拟南芥相关数据,通过生物信息学手段,鉴定杜梨NHX基因家族成员;通过MEGA7.0软件进行序列比对以及进化分析;通过在线工具Pfam、SMART以及GSDS进行基因结构分析;通过定量PCR技术分析非生物胁迫下基因在不同组织中的表达特征;应用火焰石墨炉原子吸收光谱仪测定NaCl胁迫下杜梨不同组织中Na+与K+含量.[结果]成功鉴定出16个候选基因,其中有4个基因属于NHX亚家族,4个基因属于CHX亚家族,8个基因属于KEA亚家族.预测的候选基因均含有Na+/H+ exchange功能域;NaCl胁迫下,预测的16个基因在叶片中的表达差异大,但在8h以后均为负调控;在茎中,PEG6000处理下,PbNHX1的表达量显著增高,且高于同一时期NaCl胁迫下的表达水平,仅在48 h时低于同一时期NaCl胁迫下的表达水平;在根中,基因PbN-HX12、PbNHX13、PbNHX14和PbNHX15在NaCl胁迫和PEG6000处理下在任何时间段均为负调控.[结论]在盐胁迫过程中,与拟南芥NHX基因进化关系最近的PbNHX1和PbMHX11呈现出负调控模式,与拟南芥KEA基因进化关系相近的PbNHX10和PbNHX7可能参与K+的运输.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张绍铃		271	4662	36.0	50.0
2	李慧		18	143	8.0	11.0
3	常有宏		5	94	2.0	5.0
4	王影		1	0	0.0	0.0
5	蔺经		1	0	0.0	0.0
6	杨青松		1	0	0.0	0.0