谷子SSR标记在狗尾草中的有效性检测

• 作者: 张佳乐 永辉 王伟平 王冬雪 王宇 王春苗 相吉山 贾斌 赖佳成 赵舒楠
• 来源期刊: 农业技术与装备
• 学科: 农学
• 关键词: 青狗尾草 SSR标记 有效性
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 17-21
• 页数: 5页
• 分类号: S544+.3
• 字数: 2875字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-887X.2019.04.006

摘要

狗尾草(S.viridis (L.)Beauv.)为一年生草本植物,是谷子(S.italica(L.)P.Beauv.)的祖本植物.本研究采集赤峰地区狗尾草种质资源,随机挑选40份材料,利用种子发芽并提取叶片基因组DNA,构建混池.利用361对谷子SSR标记对狗尾草基因组DNA混池进行PCR检测,有311对(86.15％)标记能够扩增出目的片段.其中,1号～9号染色体SSR标记依次为38对、42对、43对、34对、42对、34对、8对、26对、44对,平均距离依次为1.11Mbp、1.17Mbp、1.18Mbp、1.19Mbp、1.13Mbp、1.06Mbp、4.50Mbp、1.57Mbp、1.34 Mbp.相比较而言,1号染色体上的SSR标记在检测狗尾草时有效性最高(100.00％),7号染色体上的有效性最低(24.24％),说明谷子不同染色体上的SSR标记在狗尾草中的有效性不同.这些有效的SSR标记可作为狗尾草遗传相关研究的核心引物.