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一个高抗玉米南方锈病基因的QTL定位及遗传分析
一个高抗玉米南方锈病基因的QTL定位及遗传分析
作者:
时成俏
王兵伟
覃嘉明
覃永嫒
郑加兴
黄安霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
玉米
南方锈病
抗性
QTL定位
摘要:
[目的]通过对一个热带高抗玉米南方锈病材料S313与4个高感玉米南方锈病材料组配的8个F2群体进行两年三季的遗传分析,在表型鉴定的基础上,利用其中1个F2群体进行局部遗传图谱构建及抗性基因定位,并利用大群体及新开发的分子标记对抗性主效QTL进行精细定位,为进一步克隆该基因奠定基础.[方法]连续三季对8个F2分离群体,分3个时期进行病原菌接种,玉米生长后期按1—9级标准等级记载各单株的抗南方锈病级数,进行抗性表型鉴定,最终确定抗、感分离比例.利用56K芯片筛选出2个亲本间多态标记,选择其中均匀分布的192个标记对S313×PHW52的F2群体中各30个高抗、高感子代进行KASP分型.利用第10染色体短臂上19个SNP标记对整个F2群体进行分型,构建局部遗传图谱;将遗传图谱与田间抗性表型鉴定结果相结合进行抗性QTL定位.开发初定位区间内10个SNP标记对次级群体进行标记分型,根据交换单株数量大小进一步缩小定位区间.根据玉米B73 Ref Gen_V4参考基因组信息,列出对应定位区间内的所有基因,利用基因的功能注释信息,确定可能与玉米抗南方锈病相关的候选基因.[结果]8个F2群体田间抗、感分离比均符合3﹕1的分离比例,说明热带自交系S313对玉米南方锈病的抗性是由1个效应比较大的主效QTL控制.利用56K芯片筛选出2个亲本间的多态标记16426个.利用192个标记对各30个抗、感子代进行连锁分析,获得了1个抗性连锁标记Affx-90241059.利用19个SNP标记构建了总遗传距离为31.8 cM,标记间平均距离1.77 cM的局部遗传图谱.利用复合区间作图法把该主效QTL定位在标记Affx-91298359与标记Affx-91182449之间,区间大小约2 M.进一步利用F2大群体及10个SNP标记把该区间缩小到474 K的范围内.玉米参考基因组B73的对应区间内共有63个基因,其中3个基因LOC103640657、LOC100191493、LOC103640673编码的蛋白质与植物抗病性有关,因此把这3个基因列为热带玉米种质S313高抗玉米南方锈病的抗性候选基因.[结论]S313对玉米南方锈病的抗性是由1个主效QTL控制,并且S313的主效基因定位在第10染色体短臂约0.47 M的范围内.在该范围内有3个玉米南方锈病抗性候选基因.
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内容分析
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文献信息
篇名
一个高抗玉米南方锈病基因的QTL定位及遗传分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
玉米
南方锈病
抗性
QTL定位
年,卷(期)
2019,(12)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
2033-2041
页数
9页
分类号
字数
7139字
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2019.12.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王兵伟
广西农业科学院玉米研究所
22
112
7.0
9.0
2
覃永嫒
广西农业科学院玉米研究所
21
101
7.0
8.0
3
覃嘉明
广西农业科学院玉米研究所
18
85
6.0
7.0
4
黄安霞
广西农业科学院玉米研究所
18
86
6.0
8.0
5
时成俏
广西农业科学院玉米研究所
22
110
7.0
9.0
6
郑加兴
广西农业科学院玉米研究所
17
74
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7.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
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共引文献
(89)
参考文献
(33)
节点文献
引证文献
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同被引文献
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引证文献(2)
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南方锈病
抗性
QTL定位
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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