谷胱甘肽过氧化物酶1在肝癌组织中的表达及其意义的生物信息学分析

• 作者: 王烁 苗雄鹰 陈波
• 来源期刊: 中国普通外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝肿瘤 谷胱甘肽过氧化酶 生物标记,肿瘤 计算生物学
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 179-187
• 页数: 9页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.7659/j.issn.1005-6947.2019.02.008

摘要

目的:通过生物信息学的方法分析谷胱甘肽过氧化物酶1(GPX1)在肝癌组织中的表达及意义.方法:从Ualcan数据库获取正常肝组织及原发性肝癌组织GPX1表达数据,在LinkedOmics中检索GPX1的共表达基因,并通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因的参与的生物学过程及功能,利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络.最后利用GEPIA数据库分析GPX1表达与肝癌患者预后的关系.结果:与正常肝组织比较,不同分期(Ⅳ期除外)、不同年龄患者肝癌组织中GPX1表达水平均明显升高,且男性肝癌患者肝癌组织中GPX1表达明显高于女性患者(均P＜0.05).GPX1共表达基因主要参与基因转录、翻译、蛋白泛素化、蛋白质磺酰化、mRNA稳定性调节、蛋白酶体复合体、线粒体翻译等分子生物学过程,并参与TGF-β、mTOR、WNT、MAPK、HIF-1 α、NF-κB、VEGF、Notch等信号通路及各种癌症疾病通路.10个肝癌相关基因编码的蛋白与GPX1所编码的蛋白存在互作关系.GPX1高表达患者的总生存率、无病生存率均明显低于GPX1低表达患者(P=0.048、P=0.035).结论:GPX1在肝癌组织中高表达,且与肝癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为肝癌筛选、预后预测的标志物之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苗雄鹰	中南大学湘雅二医院普外肝胆专科	172	706	12.0	18.0
2	陈波	中南大学湘雅二医院普外肝胆专科	28	114	5.0	10.0
3	王烁	中南大学湘雅二医院普外肝胆专科	5	2	1.0	1.0