西藏小型猪多组织组蛋白修饰谱研究

• 作者: 于欣鑫 刘闻 秦锐 陈娜 顾为望 高飞
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 西藏小型猪 动物模型 ChIP-Seq 组蛋白修饰
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 17-22
• 页数: 6页
• 分类号: R-33
• 字数: 3852字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2019.05.003

摘要

目的 对西藏小型猪全基因组范围内的组蛋白修饰位点进行注释,并比较不同组织间组蛋白修饰的差异.方法 取三月龄的雄性非同胎西藏小型猪两只,分别取其血液、肝、小肠(回肠段)和背最长肌的组织样本,进行染色质免疫共沉淀实验,捕获DNA片段进行高通量测序.下机数据经过滤后比对到参考基因组上,并使用MACS软件统计reads在基因组上的富集情况.结果 不同组蛋白在基因启动子区域分布的偏好位置不同,分布规律大致分为两类,一类如H3K4me3组蛋白修饰主要分布在转录起始位点附近的两侧,并在距离TSS较近的下游位置出现一个宽度较窄的明显的峰值,另一类如H3K9me3组蛋白修饰在整个启动子区域内分布较为平均,整体呈现出中间低两边高的宽峰形状;组织特异性组蛋白修饰影响的基因存在差异,对应的功能通路比较广泛,但都参与了RNA聚合酶II启动子的转录调控.结论 本研究提供了西藏小型猪四种组织的组蛋白修饰注释数据,为今后以西藏小型猪为生物医学模型的转录调控研究提供了基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾为望	南方医科大学实验动物中心	149	929	15.0	22.0
3	高飞	中国农业科学院深圳农业基因组	33	337	8.0	18.0
4	刘闻	南方医科大学实验动物中心	5	5	1.0	2.0
8	陈娜	中国农业科学院深圳农业基因组研究所	6	10	2.0	3.0
11	秦锐	中国农业科学院深圳农业基因组研究所	1	0	0.0	0.0
12	于欣鑫	中国农业科学院深圳农业基因组研究所	1	0	0.0	0.0