基于生物信息学和质谱技术的阿胶特异性肽段筛选与鉴定

• 作者: 叶茂 国锦琳 彭成 曹秀君 王芳 童芯锌 范雨
• 来源期刊: 中国现代中药
• 学科: 医学
• 关键词: 阿胶鉴定 胰酶 特异肽段 生物信息学 超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1256-1261,1266
• 页数: 7页
• 分类号: R282.74|R282.5|R284
• 字数: 4981字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20190320005

摘要

目的:建立基于生物信息技术和液质联用技术识别特征肽鉴别阿胶的新方法.方法:利用生物信息技术对驴皮、牛皮和猪皮I型胶原蛋白α1链氨基酸序列进行同源性比对发现3种皮类胶原蛋白氨基酸序列存在差异,通过生物学软件模拟胰酶酶解,分析比对驴皮、牛皮、猪皮来源Ⅰ型胶原蛋白α1链酶解肽段,然后通过实验对样品前处理条件进行系统摸索,采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UPLC/Q-TOF-MS)进行验证.结果:筛选出12个驴皮的特异性肽段,鉴定出1个与预测结果一致的驴皮特异性肽段,其质荷比(m/z)为766.4,分子量为1 530.802 2,对应的多肽序列为GEAGPAGPAGPIGPVGAR,利用特征肽段对10组阿胶样品进行鉴定.结论:生物信息技术结合UPLC/Q-TOF-MS检测出的驴皮特征肽可有效、特异、准确地对阿胶药材进行专属性鉴定.