基于SLAF-seq技术构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质

• 作者: 李开祥 杜德志 柳海东 贾永鹏 赵绪涛
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 波里马雄性不育恢复系 SNP分子标记 SLAF标签 核心种质
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 497-506
• 页数: 10页
• 分类号: S565.4
• 字数: 6616字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2019.04.003

摘要

为加快选育适应春油菜区的强优势杂交种,构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质,以118份波里马不育系的恢复系为材料,利用简化基因组测序技术(SLAF-seq),开发SNP标记,分析群体遗传关系,结合Core Hunter软件进行核心种质构建,得到2516个有效SNP标记位点.基于有效SNP标记,对118份资源进行遗传分析,结果显示:恢复系间平均Nei's遗传距离为0.319,含有不同遗传成分的恢复系之间遗传距离较大;118份资源被聚成5类,来源相同的材料大多被分为同一类;获得两个符合要求的核心种质子集,分别包含34份材料和46份材料,分别命名为C30和C40.通过评价这两种核心种质,等位基因覆盖度都达到了99.8％以上,MR(罗杰斯距离)和CE(卡瓦利-爱德华距离)两种遗传距离指数相差不大,且多态性含量达到了0.28,表明构建的甘蓝型油菜恢复系的核心种质可以代表118份资源,符合植物资源核心种质的构建要求.