采用SLAF-seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点

• 作者: 任莉 刘凡 徐理 方小平 曾令益 王伟 陈旺 黄炳文
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 霜霉病 分子标记 SLAF SNP
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 555-562
• 页数: 8页
• 分类号: S565.403|S435.654
• 字数: 6133字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2016.05.003

摘要

由寄生霜霉(Hyaloperonospora parasitica)引起的油菜霜霉病(downy mildew)是油菜主要病害之一.本研究通过将抗霜霉病和感病亲本油菜杂交、F1自交,得到F2分离群体,构建抗、感病混池,采用BSA和SLAF(specific length amplified fragment sequencing)技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性相关分子标记.参考已公布油菜(Brassica napus)基因组设计酶切方案,构建SLAF文库并进行双端测序,共开发出132 519个SLAF标签,再通过分析SLAF标签的多态性,检测到264 256个SNP位点.利用SNP-index方法定位关联区域,分析关联区域内的基因在两个亲本之间SNP,对这些SNP进行变异的注释,发现2个非同义突变的SNP,分别是BDsnp01和BDsnp02.经验证,这2个SNP位点是与霜霉病抗性相关的并且在亲本和F2中稳定遗传.使用SNAPER软件设计2对特异引物能够利用电泳直接检测这两个SNP.