杨树miRNA的靶基因预测及低氮胁迫表达分析

• 作者: 徐千惠 王延伟 霍晓薇
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 毛白杨 低氮胁迫 miRNA 靶基因 差异表达
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 28-37
• 页数: 10页
• 分类号: S792.95|Q756
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20190205

摘要

[目的]鉴定杨树受低氮胁迫后miRNA的靶基因,分析靶基因在氮胁迫后的差异表达并探讨其功能,为揭示杨树低氮胁迫下miRNA的调控功能提供参考,并为树木低氮营养高效利用育种提供重要的候选基因.[方法]根据miRNA的保守性及与靶基因的严谨互补配对关系,以杨树miRNA为探针利用靶基因预测软件psRNATarget,通过与毛白杨转录组的基因序列进行比对鉴定靶基因,进一步开展毛白杨受低氮胁迫后靶基因的差异表达分析及功能注释.[结果]获得了131个miRNA家族的242个miRNA成员对应的3024个靶基因,分别参与了植物激素信号转导、次生代谢产物的生物合成、氨基酸合成代谢、碳代谢和RNA运输等通路.57个靶基因在低氮胁迫处理后发生显著变化,其中受到诱导(29个)和抑制(28个)的基因数目相当.14个低氮胁迫响应的miRNA,其对应的11个靶基因也发生了显著的差异表达变化,其中miRNA和靶基因表达量发生相反变化的有8个miRNA.本研究发现参与植物激素信号转导的靶基因(2个)及参与代谢途径的靶基因(6个)发生了差异表达.miR162的靶基因编码ABC转运蛋白,miR393运用于靶基因KAT2调节Na+和K+动态平衡,miR399的靶基因PIF3编码光敏色素互作因子PIFs蛋白,这些miRNA及靶基因可能在杨树响应低氮胁迫中发挥重要作用.[结论]本文鉴定到了毛白杨中一批低氮胁迫响应miRNA的靶基因,可调控杨树对氮逆境胁迫信号的反应.这些miRNA及靶基因为进一步揭示miRNA及靶基因在低氮胁迫下的调控功能提供了研究线索,为树木氮营养的高效利用改良提供了重要候选基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	霍晓薇		1	0	0.0	0.0
2	徐千惠		1	0	0.0	0.0
3	王延伟		1	0	0.0	0.0