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摘要:
目的 使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙型肝炎病毒(HCV)混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点.方法 在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果 提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证.结果 HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者(77.7%对19.6%P<0.001),HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者(48.6%对3.2%P<0.001);HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为(15456±6689)reads,HCV感染者为(14323±5321)reads,两组无显著差异(P>0.05);HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为(16432±3467)reads,HCV感染者为(17611±5632)reads,也无显著差异(P>0.05);本组228例(97.9%)HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者(分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005),HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者(20.0%对59.4%,P<0.001);在233例入组的HCV感染者中,发现5例(2.1%)为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者.结论 广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨.
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文献信息
篇名 HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析
来源期刊 实用肝脏病杂志 学科
关键词 慢性丙型肝炎 艾滋病 HCV基因型 二代测序
年,卷(期) 2019,(5) 所属期刊栏目 病毒性肝炎
研究方向 页码范围 656-659
页数 4页 分类号
字数 2082字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5069.2019.05.011
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 邓浩辉 广州市广州医科大学附属市八人民医院重症肝病科 1 1 1.0 1.0
2 李晓强 广州市广州医科大学附属市八人民医院重症肝病科 1 1 1.0 1.0
3 高洪波 广州市广州医科大学附属市八人民医院重症肝病科 1 1 1.0 1.0
4 陈伟烈 广州市广州医科大学附属市八人民医院传染病研究所 1 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
慢性丙型肝炎
艾滋病
HCV基因型
二代测序
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用肝脏病杂志
双月刊
1672-5069
34-1270/R
大16开
合肥市长江西路424号
26-201
1996
chi
出版文献量(篇)
4015
总下载数(次)
5
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