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本生烟响应蛋白激发子PevD1的差异表达基因鉴定与分析
本生烟响应蛋白激发子PevD1的差异表达基因鉴定与分析
作者:
曾洪梅
李广悦
李泽
杨秀芬
梁颖博
邱德文
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
本生烟
大丽轮枝菌
蛋白激发子PevD1
RNA-Seq
LRR-RLKs
转录因子
PR蛋白
摘要:
[目的]通过RNA-Seq筛选本生烟(Nicotiana benthamiana)响应大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)蛋白激发子PevD1的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),分析PevD1诱导植物产生抗病性的潜在分子机制.[方法]用10 μmo l·L-1的PevD1蛋白液渗入4周龄的本生烟叶片,分别在处理后6、12和24 h取样提取RNA,构建mRNA文库后采用BGISEQ-500平台进行测序.筛选各时间点的差异表达基因进行GO和KEGG分析;重点分析与诱导抗病相关的富含亮氨酸重复序列类受体蛋白激酶(leucine-rich repeats RLKs,LRR-RLKs)、转录因子(transcription factor,TF)以及病程相关蛋白(pathogenesis related protein,PR蛋白)家族差异表达基因;采用qRT-PCR对差异表达基因进行定量验证.[结果]GO功能富集以及KEGG通路富集分析表明,PevD1诱导6h后的差异表达基因主要与细胞识别、光合作用、光收割等功能相关,显著富集在光合作用-天线蛋白通路、萜类化合物合成通路、黄酮和黄酮醇等次生代谢产物合成相关通路中;12 h和24 h的差异表达基因主要与细胞识别和胞内激酶等生物学功能相关,显著富集在植物-病原互作通路、倍半萜和三萜生物合成通路、黄酮和黄酮醇生物合成通路、亚麻酸代谢等次生代谢产物合成相关通路中.与光合作用相关的差异表达基因主要呈下调趋势,与萜类、黄酮类等抗病相关次生代谢产物合成通路相关的差异表达基因主要呈上调趋势.PevD1诱导后大量的LRR-RLKs、TF以及PR蛋白家族基因显著上调表达,这些基因与激发子识别、基因转录调控和抗病性相关.经qRT-PCR验证后,所检测基因的表达趋势与转录组测序结果一致.[结论] PevD1诱导本生烟中大量基因转录重排,大量LRR-RLKs、TF和PR蛋白家族基因上调表达,激活了植物免疫系统,使植物产生抗病性.研究结果可为今后深入探讨PevD1诱导植物免疫的机理提供依据.
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蛋白激发子
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盐胁迫
大丽轮枝菌蛋白激发子PevD1诱导的烟草对烟草花叶病毒(TMV)系统获得性抗性及其分子机制
蛋白激发子
防御酶
抗性相关基因
诱导抗性
系统性抗性
内容分析
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引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
本生烟响应蛋白激发子PevD1的差异表达基因鉴定与分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
本生烟
大丽轮枝菌
蛋白激发子PevD1
RNA-Seq
LRR-RLKs
转录因子
PR蛋白
年,卷(期)
2019,(21)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
3794-3805
页数
12页
分类号
字数
6212字
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2019.21.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李广悦
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
5
14
2.0
3.0
2
曾洪梅
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
43
418
12.0
19.0
3
邱德文
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
104
1657
20.0
38.0
4
李泽
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
4
4
1.0
2.0
5
梁颖博
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
4
1
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1.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
(230)
共引文献
(133)
参考文献
(34)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
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参考文献(1)
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2019(1)
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节点文献
本生烟
大丽轮枝菌
蛋白激发子PevD1
RNA-Seq
LRR-RLKs
转录因子
PR蛋白
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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