结核分枝杆菌复合体VNTR位点多态性与菌株MALDI-TOF MS蛋白谱差异的关系

• 作者: 刘敏雪 宋启飞 巫丽娟 戴仲秋 李梦娇 杜宝中 熊丽 谢轶
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 关键词: 结核分枝杆菌复合体 数目可变串联重复序列 MALDI-TOF MS 主成分分析 多态性
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 872-877
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

目的 研究结核分枝杆菌复合体(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)数目可变串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)重复单位拷贝数与菌株蛋白质谱差异的关系.方法 采用多位点数目可变串联重复序列分析(multiple locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)对MTBC进行基因分型.同时,利用基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser-desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对菌株的蛋白质谱进行主成分分析(principal components analysis,PCA),分析VNTR位点重复单位拷贝数差异(多态性)与菌株PCA聚类的关系.结果 共收集157株MTBC菌株.146株MTBC(质谱鉴定得分≥1.700)生成的PCA树状图分为3个群,分别为Ⅰ群(61株)、Ⅱ群(26株)和Ⅲ群(59株).24个VNTR位点多态性存在差异,其中7个高、7个中等和10个低多态性.MTBC菌株的Mtub39、QUB26、QUB4156位点多态性与菌株MALDI-TOF MS聚类有关(P=0.000,P=0.035,P=0.017).结论 MTBC菌株的Mtub39、QUB26、QUB4156位点多态性与菌株蛋白质谱的差异有关,3个位点可能具有调控菌株蛋白质谱构成的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢轶	四川大学华西医院实验医学科	60	250	9.0	12.0
2	杜宝中	西藏大学医学院病原生物学教研室	27	64	5.0	7.0
3	刘敏雪	四川大学华西医院实验医学科	11	29	3.0	5.0
4	李梦娇	四川大学华西医院实验医学科	8	8	2.0	2.0
5	宋启飞	四川大学华西医院实验医学科	9	8	2.0	2.0
6	巫丽娟	四川大学华西医院实验医学科	19	26	4.0	4.0
7	戴仲秋	四川大学华西医院实验医学科	13	16	2.0	4.0
8	熊丽	四川大学华西医院实验医学科	9	4	2.0	2.0