水稻RNA结合蛋白C3H12与RNA结合位点的鉴定

• 作者: 方涵 智东明 王媛媛 邓汉卿 陶虎
• 来源期刊: 中国生物化学与分子生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: CCCH型锌指蛋白质 RNA结合蛋白质 等温滴定量热法 荧光光谱分析 微型热泳动
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1275-1283
• 页数: 9页
• 分类号: Q51|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.13865/j.cnki.cjbmb.2019.11.13

摘要

CCCH型锌指蛋白质C3H12是进化上保守的RNA结合蛋白质,它含有5个串联的CCCH锌指结构域ZnF1-5,形成2个紧密的锌指簇ZnF1-3和ZnF4-5.早期的研究发现,C3H12可能通过与mRNA结合的方式在转录后水平调控基因的表达.然而,与C3H12结合的mRNA类型和他们的结合模式,并未通过实验得到证明.本文表达纯化了一系列C3H12截短及全长蛋白质,并合成了一些潜在RNA底物ARE9、ARE19及对照Random21.通过等温滴定量热法(isothermal titration calorimetry,ITC)确定了C3H12与富含腺嘌呤尿嘧啶单元(AU-rich element,ARE) mRNA底物的结合,并揭示了互作核心区域和热力学性质.通过荧光光谱分析和微型热泳动(microscale thermophoresis,MST)技术对ITC的结果进一步佐证.结果 表明:(1)C3H12与ARE底物的相互作用是焓驱动的能量有利的(△G＜0)特异性结合,结合比为1:1.(2) C3H12与ARE19的亲和力较ARE9更高(约2倍).(3) C3H12中ZnF1-3在与ARE类底物的结合活性中发挥主导作用.(4)C3H12结构中的141个氨基酸残基的接头不直接参与和ARE底物的相互作用.本研究揭示的CCCH型锌指蛋白质C3H12与ARE底物结合模式,将为进一步在分子结构水平阐明C3H12与ARE底物结合的机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王媛媛		13	22	3.0	4.0
2	陶虎		15	5	1.0	1.0
3	邓汉卿		6	5	1.0	2.0
4	方涵		2	0	0.0	0.0
5	智东明		2	0	0.0	0.0