美国短毛黑水貂快速生长过程中转录组差异表达分析

• 作者: 孙丽敏 张然然 徐佳萍 杨颖 涂剑峰 王天娇 荣敏 邢秀梅
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水貂 肌肉 生长 转录组
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1787-1801
• 页数: 15页
• 分类号: S865.22
• 字数: 7111字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.09.006

摘要

旨在对美国短毛黑水貂快速生长过程中转录组差异表达进行分析.本试验将美国短毛黑水貂45、90日龄各3只健康公貂的胸肌组织作为试验材料,利用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台建立转录组文库,对两个生长阶段差异显著性的基因进行GO功能富集和KEGG Pathway分析,寻找调控水貂快速生长期的相关候选基因和代谢通路,并利用qRT-PCR对转录组测序结果进行验证.结果 表明,以P＜0.05,| log2 FC[＞1为条件筛选到279个显著差异基因,对这些差异基因进行GO和KEGG分析,筛选到与肌肉生长相关显著富集GO条目有66条、相关差异表达基因44个,其中上调20个,下调24个;与肌肉生长相关显著富集KEGG通路12条,如p53信号通路、PPAR信号通路、FOXO信号通路等.这些差异基因可能在水貂的快速生长过程中起到调控作用,可以作为后续研究水貂生长发育的候选基因.本研究结果为探究水貂生长发育调控机制及培育大体型水貂品种奠定基础.