小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达

• 作者: 周博如 廖诗贤 张月 胡号东 韩雅婷
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 小黑杨 叶枯病 转录组 高通量测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 页码范围: 113-117
• 页数: 5页
• 分类号: S763.15
• 语种: 中文

摘要

为揭示小黑杨(Populus simonii×P.nigra)在叶枯病病原菌(Alternaria alternata)胁迫下基因差异表达情况,以叶枯病病原菌接种叶片处理组,以无菌PDA培养基处理为对照组,用Illumina HiSeq测序平台对来自小黑杨叶片的RNA进行测序.结果表明:共得到551个差异表达基因,对差异表达基因进行功能注释并整理分类,获得112个编码酶类的基因,116个编码蛋白的基因.通过与GO数据库比对,其中38个差异表达基因属于生物过程,有333个差异表达基因属于分子功能,有11个差异表达基因属于细胞组分.通过与KEGG数据库进行比对,获得14条代谢通路.与TFDB数据库比对,发现27个转录因子,属于14个转录因子家族.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周博如		14	78	5.0	8.0
2	张月		4	23	1.0	4.0
3	韩雅婷		1	0	0.0	0.0
4	胡号东		1	0	0.0	0.0
5	廖诗贤		1	0	0.0	0.0