光照胁迫下广叶绣球菌菌丝基因差异表达的初步分析

• 作者: 张迪 林衍铨 王宏雨 肖冬来 马璐
• 来源期刊: 中国食用菌
• 关键词: 广叶绣球菌 转录组 GO功能分析 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 生理生化
• 页码范围: 60-63
• 页数: 4页
• 分类号: S646.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13629/j.cnki.53-1054.2017.05.014

摘要

利用高通量测序技术对黑暗和光照下广叶绣球菌(Sparassis latifolia)菌丝进行RNA-Seq分析,比较光照胁迫下的差异表达基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析.结果表明,光照胁迫下显著性差异表达的基因328个,其中,上调、下调表达的基因数分别为157个和171个.差异表达基因的GO注释表明,生物学过程主要为细胞过程、代谢过程、单一生物过程,而分子功能主要为催化、结合和转运子活性.KEGGpathway功能分析结果表明,差异基因主要集中在次级代谢产物合成、淀粉和蔗糖代谢和谷胱甘肽代谢通路中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林衍铨	福建省农业科学院食用菌研究所	68	321	10.0	14.0
2	马璐	福建省农业科学院食用菌研究所	25	101	5.0	9.0
3	王宏雨	福建省农业科学院食用菌研究所	25	71	5.0	5.0
4	张迪	福建省农业科学院食用菌研究所	25	80	4.0	7.0
5	肖冬来	福建省农业科学院食用菌研究所	20	54	3.0	6.0