原文服务方: 中国临床药理学与治疗学       
摘要:
目的:利用数据挖掘结果,采用网络药理学和生物信息学方法,分析传统中药虎杖抗高血脂的作用及信号通路.方法:采用TCMSP数据库从虎杖中筛选出主要活性成分,利用Drug-CPI服务器反向药效团匹配方法,预测并获得虎杖主要活性成分靶点.通过OMIM、TTD、Genecards等疾病靶点数据库筛选出高血脂相关疾病靶点,获得活性成分靶点和疾病靶点交集.采用Cytoscape 3.7.1软件构建虎杖可视化网络,应用STRING在线平台对交集靶点进行蛋白互作网络分析,同时对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析.根据KEGG通路分析结果,应用Autodock 4.2.6分子对接软件研究虎杖中相关活性成分与胰岛素抵抗和PPAR信号通路中的关键靶点蛋白,即TNFRSF1 A和PPARG的结合作用强弱与结合机制.结果:采用TCMSP数据库从虎杖中筛选出12个主要活性成分,并预测获得288个靶点.从疾病靶点数据库筛选出高血脂相关疾病靶点571个,并获得虎杖潜在抗高血脂作用靶点共48个.构建了"药物-活性成分-靶点-疾病"网络,该网络中化合物的平均度值为16.67,其中有8个化合物能与15个及以上靶点发生相互作用.KEGG通路富集分析的结果发现48个作用靶点主要参与调控胰岛素抵抗(insulin resistance)、PPAR信号通路(PPAR signaling pathway)、非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)、HIF-1信号通路(HIF-1 signaling path-way)、调节脂肪细胞中的脂肪分解(regulation of lipolysis in adipocytes)等信号通路.分子对接结果表明,4个活性成分均能与TNFRSF1 A结合,其中rhein(大黄酸)与TNFRSF1 A结合能最低,为-10.08 kcal/mol.在虎杖的7个活性成分中,physovenine(囊毒碱)与PPARG的结合能最低,为-13.45 kcal/mol.结合方式主要以氢键、静电力及疏水作用为主.结论:虎杖活性成分可能通过参与调控胰岛素抵抗、PPAR信号通路以及调节脂肪细胞中的脂肪分解等信号通路调节脂质代谢,从而实现抗高血脂的作用.
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文献信息
篇名 基于网络药理学的虎杖抗高血脂作用及信号通路研究
来源期刊 中国临床药理学与治疗学 学科
关键词 高血脂 虎杖 靶点预测 PPAR信号通路 胰岛素抵抗
年,卷(期) 2019,(10) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 1107-1119
页数 13页 分类号 R965.2|R282|R932
字数 语种 中文
DOI 10.12092/j.issn.1009-2501.2019.10.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郭丽 嘉兴市第二医院中心实验室 28 37 3.0 3.0
2 鲍轶 嘉兴市第二医院中心实验室 13 18 3.0 3.0
3 吴加元 嘉兴市第二医院中心实验室 3 5 2.0 2.0
4 莫娟芬 嘉兴市第二医院中心实验室 8 9 2.0 2.0
5 郑丽 嘉兴市第二医院中心实验室 2 3 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
高血脂
虎杖
靶点预测
PPAR信号通路
胰岛素抵抗
研究起点
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研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国临床药理学与治疗学
月刊
1009-2501
34-1206/R
大16开
1996-01-01
chi
出版文献量(篇)
5571
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