通过生物信息学方法筛选新的非酒精性脂肪性肝炎关键基因

• 作者: 冯巩 刘曼玲 刘艳 弥曼 李丽莉 李雪萍 牛春燕# 范立萍 贺娜
• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 非酒精性脂肪性肝炎 差异性表达基因 芯片 蛋白-蛋白相互作用
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 肝与肝病
• 页码范围: 1060-1065
• 页数: 6页
• 分类号: R575.1
• 字数: 4822字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13753/j.issn.1007-6611.2019.08.006

摘要

目的 通过生物信息学方法筛选新的非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)关键基因,从而为NASH的诊断和治疗以及科研提供新的思路与方法.方法 通过GEO(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取关于NASH的基因表达芯片数据,进一步通过GEO2R在线分析工具分析手段获得NASH和正常组织的差异化表达基因(differenti-ally expressed genes,DEGs).随后,对这些DEGs进行功能富集分析,同时借助于蛋白-蛋白相互作用网络图分析(protein-pro-tein interaction,PPI)去寻找NASH发生和发展的潜在分子作用机制.结果 获得GSE17470芯片,514个DEGs以及11个关键基因(VEGFA、FOS、CAT、ALDH7A1、ALDH1B1、ALDH1A1、ALDH2、ERBB2、ALDH1L1、TF、ALDH8A1),功能富集分析提示DEGs多参与代谢过程,包括三大营养物质(糖类、脂肪、蛋白质)代谢,尤其是脂质代谢,同时与氧化还原生理过程密切相关,其中3个关键基因(CAT、ALDH2、ALDH8A1)与肝癌的生存分析具有紧密联系,可能与NASH发展到HCC密切相关.结论这些筛选出来的NASH关键基因在未来可能会成为NASH新的诊断生物学标志物或靶向性治疗的目标,为未来本领域的科学探索奠定新的方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	弥曼	西安医学院全科医学研究所	72	374	10.0	17.0
2	李雪萍	西安医学院全科医学研究所	30	66	4.0	7.0
3	冯巩	西安医学院全科医学研究所	19	31	3.0	5.0
4	刘曼玲	西安医学院全科医学研究所	20	74	5.0	8.0
5	范立萍	西安医学院全科医学研究所	8	4	1.0	2.0
6	贺娜	西安医学院第一附属医院消化内科	10	2	1.0	1.0
7	刘艳	宝石花长庆职工医院兴隆园医院影像科	1	0	0.0	0.0
8	李丽莉	宝石花长庆职工医院兴隆园医院医务科	1	0	0.0	0.0
9	牛春燕#	西安医学院全科医学研究所	1	0	0.0	0.0