基于网络解卷积和网络沉默算法的高维数据网络优化策略与比较

• 作者: 李康 王文杰 荣志炜
• 来源期刊: 中国卫生统计
• 关键词: 基因调控网络 网络优化 网络解卷积 网络沉默
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 应用研究
• 页码范围: 68-70,74
• 页数: 4页
• 字数: 2476字
• 语种: 中文

摘要

目的 根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化.本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略.方法 分别使用7种方法 构建网络,然后使用ND和Silencing算法对网络优化,再通过ROC-PR曲线的评分对其效果进行比较,最后用网络结构分析方法 评价去除间接效应的能力.结果 两种方法对大多数网络都有较好的优化能力,能够很好地去除间接效应;相对而言,ND方法略优于Silencing方法.结论 使用RF+ND和CLR+ Silencing方法构建网络是两种较好的网络构建策略.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李康	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	95	646	15.0	21.0
2	王文杰	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	8	25	3.0	5.0
3	荣志炜	哈尔滨医科大学卫生统计学教研室	1	0	0.0	0.0