基于地黄转录组数据的SNP标记开发与地黄指纹图谱构建

• 作者: 周延清 杨珂 段红英 邵露营 郭萌萌
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 地黄 转录组 SNP标记开发 指纹图谱 品种鉴定
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 224-230
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0409

摘要

地黄(Rehmannia glutinosa)是一种具有较高药用价值和经济价值的植物.准确的品种鉴定对地黄种质管理和育种至关重要,使用SNP分子标记来鉴定地黄种质和构建指纹图谱对地黄分子标记育种提供了新方法.利用地黄转录组数据和SRA数据库中的3个地黄转录组数据比对,寻找候选SNP,用PCR技术扩增和序列分析研究28个地黄品种候选SNP变异.从地黄转录组数据中获得了102075条Unigenes,其中共有SNP位点35339个,发生频率为0.51/kb;从中随机选取40个候选SNP位点,设计引物39对,用PCR和序列分析从中筛选出7对好的SNP引物,包含8个多态性好的SNP位点;利用最终筛选出的8个SNP位点构建地黄指纹图谱,可以将17个不同地黄种质区分开,可用于地黄种间和种内品种的鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周延清	河南师范大学生命科学学院	85	1261	15.0	33.0
2	段红英	河南师范大学生命科学学院	45	382	11.0	16.0
3	杨珂	河南师范大学生命科学学院	6	15	3.0	3.0
4	郭萌萌	河南师范大学生命科学学院	6	4	1.0	2.0
5	邵露营	河南师范大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0