对中东亚人群胃癌相关易感基因的挖掘

• 作者: 安覃景 李思思 韩崇旭
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 差异基因 信号通路 中东亚人群
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 论著· 基础研究
• 页码范围: 1409-1412,1416
• 页数: 5页
• 分类号: R735.2|Q34
• 字数: 3329字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2019.12.001

摘要

目的 筛选中东亚人群胃癌的易感基因,为胃癌的诊断和治疗提供新思路.方法 在基因表达数据库(GEO)中进行检索,利用在线工具GEO2R筛选胃癌的差异表达基因,并对其进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号转导通路分析,最后利用STRING数据库对基因相关蛋白相互作用进行关联构建.结果 本研究共纳入2个数据集,通过筛选得到40个差异表达基因,其中上调基因34个,下调基因6个,并首次发现ARHGAP11A基因与胃癌相关.通过对差异表达基因的分析发现,涉及的信号通路主要有白细胞转运蛋白迁移、p53信号通路、细胞周期等.结论 利用生物信息学方法可有效地筛选出中东亚人群的胃癌易感基因,从而为胃癌发病机制的研究提供依据.