Cε3-Cε4蛋白寡核苷酸适配子结合位点的预测与筛选

• 作者: 刘世芳 刘中成 张楠 张艳芬 张苏 李飞 杨艳蕾 袁欣
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: Cε3-Cε4蛋白 NPDock程序 分子对接 适配子筛选
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 有机化学
• 页码范围: 83-89
• 页数: 7页
• 分类号: O621
• 字数: 4181字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20180428

摘要

采用NPDock程序对Cε3-Cε4蛋白与其核酸适配子A1的结合位点进行了预测与筛选,筛选出A1与Cε3-Cε4蛋白结合的关键位点.同时,根据蛋白与DNA片段复合物结合界面中氨基酸残基和碱基统计分析发现,结合界面氨基酸富集碱基G能力最强,富集碱基T和C能力次之.本文建立了以NPDock程序虚拟对接为基础的高效适配子优化方法,为相关研究提供了实验参考.