基于RNA-seq分析人肝癌耐药细胞BEL-7402/FU的差异表达基因

• 作者: 周谢海 夏泉 崔志华 张婷 许杜娟 谢刚
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肝癌耐药 RNA-seq技术 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 342-347
• 页数: 6页
• 分类号: R735.7
• 字数: 3741字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.03.002

摘要

目的 分析调控人肝癌耐药细胞BEL-7402/FU耐药的关键基因和信号通路,进而探讨引起肝癌多药耐药的可能机制,寻找逆转肝癌多药耐药的潜在靶点.方法 TRIzol法提取人肝癌细胞BEL-7402与耐药细胞BEL-7402/FU的总RNA,采用RNA-seq测序技术检测两组细胞的数字基因表达谱并筛选差异表达基因(DEGs),运用生物信息学分析方法对DEGs进行生物通路等富集分析.结果 检测到上调的DEGs数为2 899个,下调的DEGs数为3 313个;GO富集及KEGG分析发现涉及的主要生物进程为单生物体过程类别、细胞类别、结合分子功能类别,主要的信号通路为代谢通路等;PPI分析显示,在蛋白互作网络中具有重要作用的基因为TP53、EGFR、MAPK8、BCL2L1、STAT5A、STAT5B、ABALON、FYN、CDKN1A、BCL2等.结论 肝癌耐药过程涉及到多个基因和通路,这些具有差异的基因和通路或将成为逆转肝癌耐药的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏泉	安徽医科大学第一附属医院药剂科	102	1638	20.0	38.0
2	许杜娟	安徽医科大学药学院	76	1344	18.0	35.0
8	张婷	安徽医科大学药学院	80	715	16.0	22.0
9	周谢海	安徽医科大学药学院	1	0	0.0	0.0
10	谢刚	安徽医科大学药学院	1	0	0.0	0.0
11	崔志华	安徽医科大学药学院	2	0	0.0	0.0