不同阶段ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化炎症差异基因表达的比较研究

• 作者: 于永慧 刘剑刚 张大武 王承龙 董瑞红
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 动脉粥样硬化 ApoE-/-小鼠 基因芯片 炎症因子
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 短篇论著
• 页码范围: 1694-1699
• 页数: 6页
• 分类号: R543.1+2|R363.2
• 字数: 5155字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4718.2019.09.025

摘要

目的:利用Agilent基因芯片筛查ApoE-/-小鼠在动脉粥样硬化(AS)不同阶段(10周龄、15周龄和25周龄)炎症基因的表达谱变化,并利用RT-qPCR对筛选出的差异基因进行验证和演变分析.方法:60只雄性ApoE-/-小鼠随机分为3组,每组20只,设定10周龄为AS初期组,15周龄为AS早期组,25周龄为AS后期组,相同遗传背景的C57BL/6J野生型小鼠作为空白对照组.差异基因筛选采用Cy3标记的cRNA和基因芯片杂交,经洗脱、扫描图像、提取数据和标准化后,筛选出P≤0.05且上调或下调倍数≥2.0的差异基因.最后对筛选出的上述基因进行RT-qPCR定量分析.结果:(1)与对照组相比,ApoE-/-小鼠显著变化的差异基因为10周龄895个,15周龄540个,25周龄591个;(2)对差异基因功能进行GO条目分析,并去除与AS炎症反应无关的基因后选定白细胞介素12a(IL-12a)、基质金属肽酶12(MMP-12)、IL-1β、生长分化因子15(GDF-15)和干扰素γ(IFN-γ)为目标差异基因;(3)目标差异基因的RT-qPCR验证结果显示,与对照组比较,ApoE-/-小鼠10周龄IL-12a和MMP-12上调,IL-1β下调;15周龄GDF-15上调,IL-12a和IL-1β下调;25周龄IL-12a、MMP-12和GDF-15上调(P<0.05);并且10周龄IL-12a上调、15周龄IL-1β下调、25周龄MMP-12和GDF-15上调更为显著(P<0.01).结论:AS炎症基因的动态变化过程为药物干预不同阶段AS提供了干预靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王承龙	中国中医科学院西苑医院心血管病中心	75	690	15.0	24.0
2	刘剑刚	中国中医科学院西苑医院心血管病中心	172	2356	24.0	39.0
3	张大武	中国中医科学院西苑医院心血管病中心	29	124	7.0	10.0
4	于永慧	中国中医科学院西苑医院心血管病中心	6	3	1.0	1.0
5	董瑞红	中国中医科学院西苑医院心血管病中心	3	2	1.0	1.0