利用GEO在线数据构建脑胶质母细胞瘤ceRNA网络

• 作者: 周博 李丹丹 王蕾 邢仪通 阎东明 马佳康 马军
• 来源期刊: 中国实用神经疾病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 脑胶质母细胞瘤 非编码RNA 竞争内源性RNA 基因
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 论著科研之窗
• 页码范围: 1168-1172
• 页数: 5页
• 分类号: R730.264
• 字数: 1964字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12083/SYSJ.2019.11.158

摘要

目的 构建胶质母细胞瘤(GBM)ceRNA调控网络,探讨其发病机制.方法 利用GSE103229数据集的芯片数据,分析GBM中异常表达的lncRNA、mRNA和miRNA,差异基因判定标准为logFC>1,P<0.05.通过数据库分析三者之间的靶向调控关系,构建ceRNA网络并用Cytoscape软件可视化.结果 GBM差异基因中,lncRNA 1326个,癌组织中上调743个,下调583个;差异mRNA 3743个,癌组织中上调1865个,下调1878个;差异miRNA 33个,上调9个,下调24个.构建了包含miR-124、miR-128、miR-138和miR-193b的GBM的ceRNA网络.结论 成功构建了GBM相关的ceRNA网络,其中miR-124、miR-128、miR-138和miR-193b是重要的节点基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马军	郑州大学第二附属医院肿瘤科	91	332	8.0	12.0
5	王蕾	郑州大学第二附属医院放射科	66	364	6.0	18.0
6	阎东明	郑州大学第一附属医院神经外科	8	6	2.0	2.0
7	马佳康	郑州大学第二附属医院肿瘤科	9	9	2.0	2.0
8	周博	郑州大学第二附属医院肿瘤科	16	9	1.0	2.0
9	邢仪通	郑州大学第二附属医院放射科	1	0	0.0	0.0