闽西地区猪流行性腹泻病毒N基因分子进化及序列分析

• 作者: 安永帅 戴爱玲 曹雪珍 李晓华 李静楠 杨小燕 董波
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 N基因 遗传分析
• 年，卷（期）: 2019,（17）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 59-62
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65+1
• 字数: 2360字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.17.014

摘要

分析闽西地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)N基因的遗传进化特征,收集闽西地区猪流性腹泻病例组织样品8份,用逆转录PCR(RT-PCR)扩增N基因,连接至pMD-18T载体进行测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及遗传进化分析.结果显示,8株闽西流行毒株之间N基因核苷酸的同源性为9.8％ ～100.0％,推导的氨基酸序列的同源性为99.5％ ～100.0％,而闽西毒株与早期疫苗毒株CV777和SM98的同源性较远.氨基酸序列分析表明,闽西毒株氨基酸序列存在15处突变,与2010年后中国流行毒株变异位点相同.提示闽西地区毒株为目前国内流行毒株,与疫苗毒株亲缘关系较远,可能导致机体针对疫苗毒株产生的抗体不能够有效抵抗变异毒株,不能给猪群提供很好的免疫保护,因此需要基于变异毒株研究出有针对性的疫苗来预防PEDV.