基于GenBank数据对红柴胡nrDNA序列ITS2片段的分析

• 作者: 关鑫 孙明阳 徐丹丹 杨娜 王世聪 王长宝 王鹤 郭宏莉
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 红柴胡 ITS2 遗传距离 发育分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 114-116
• 页数: 3页
• 分类号: S188
• 字数: 1711字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2019.04.031

摘要

[目的]了解红柴胡nrDNA序列ITS2片段特征,为中药柴胡的分子鉴定提供科学依据.[方法]从GenBank中获取已公布红柴胡ITS全长序列38条和ITS2序列3条,利用MEGA6.0进行多序列比对,分析ITS2片段碱基成分、变异位点、信息位点,计算遗传距离,并用邻接法(NJ)构建系统聚类树.[结果]ITS2片段长度为224～230 bp,共发现14个简约信息位点,最大遗传距离0.124,系统树可明显分为4组,85.37％的聚为一组.[结论]ITS2在红柴胡居群中比较保守,可作为DNA barcoding鉴定的片段使用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王长宝	佳木斯大学生命科学学院	96	270	7.0	11.0
2	王鹤	佳木斯大学理学院	18	29	4.0	4.0
3	徐丹丹	佳木斯大学生命科学学院	5	4	2.0	2.0
4	杨娜	佳木斯大学生命科学学院	5	2	1.0	1.0
5	孙明阳	佳木斯大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
6	郭宏莉	佳木斯大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
7	关鑫	佳木斯大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0
8	王世聪	佳木斯大学生命科学学院	2	6	1.0	2.0