利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员

• 作者: 刘丹 晁燕 祁得林 章昭 郑志琴 陈棋昌
• 来源期刊: 青海大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 高通量测序 青海钩虾 转录组 细胞色素P450
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 26-32
• 页数: 7页
• 分类号: Q953.1
• 字数: 4228字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13901/j.cnki.qhwxxbzk.2020.02.005

摘要

淡水钩虾是重要的环境指示生物,尤其是细胞色素P450家族成员的表达可作为早期预警的生物标记.为了鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员,采用Illumina HiseqTM 2500高通量测序技术对青海钩虾转录组进行测序,并对P450家族成员进行分析鉴定.结果表明:青海钩虾中共获得了273507个转录本,总长为167791835 bp,隶属于233462个unigene,大小为137818327 bp.从转录本中鉴定到青海钩虾14个细胞色素P450家族成员,大部分基因均获得了全长序列60％以上的片段.