新城疫病毒非结构蛋白W的分子特征及生物信息学分析

• 作者: 夏兴霞 孙伟伟 欧阳伟 王晓丽 王晶宇 王永山 诸玉梅 钱晶
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 非结构蛋白W 分子特征 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 517-523
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.03.12

摘要

新城疫病毒W蛋白是由P基因“RNA编辑”产生的最短非结构蛋白.为了解W蛋白的分子特征,本试验利用生物信息学软件对24株遗传背景清晰的病毒信息进行分析.结果 显示,不同毒株W蛋白序列长度各有不同,存在8种不同长度(137aa、147aa、155aa、179aa、183aa、196aa、221aa和227aa),其变异呈现基因型一致性,不同基因型毒株W蛋白长度差异又与强、弱毒特征存在一定相关性.蛋白质分析软件预测结果显示,W蛋白上糖基化位点和磷酸化位点数量与其长度呈正相关性.W蛋白存在稳定的核定位信号,提示其功能活动区可能在细胞核.W蛋白长度的差异是通过改变C端结构域长度来实现的,经二级结构预测发现基因Ⅱ型(中强毒株)和基因Ⅲ、Ⅵ和Ⅶ型强毒株的C端结构域比其他毒株多出1个α-螺旋结构,推测W蛋白可能是NDV强毒株上关键的新型毒力标志.