探讨植物单染色体测序中的假阳性问题

• 作者: 刘平平 叶开玉 李洁维 王发明 莫权辉 蒋桥生 齐贝贝 龚弘娟
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 单染色体 单细胞测序 外源污染 假阳性 MDA MALBAC
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 系统与进化
• 页码范围: 16-23
• 页数: 8页
• 分类号: Q943
• 字数: 6567字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201905020

摘要

单细胞测序技术目前虽已广泛应用于人类、动物、微生物等物种的研究,但由于细胞壁的存在,使得该技术在植物上的应用举步维艰.如果能先分离出植物单条染色体,然后再应用单细胞测序技术进行扩增和测序,则可以避免细胞壁的干扰,从而具有重要的应用价值.虽然科研人员一直尝试针对单条植物染色体进行测序,但目前尚未见有成功的报道,也未见有文章对失败的原因进行讨论.该研究以六倍体中国春小麦为材料,针对使用单细胞测序技术进行单染色体扩增过程中出现的假阳性问题进行了探讨,分析了单染色体扩增失败的主要原因,并通过高通量测序技术研究了外源污染的可能来源.结果表明:在对实验器具、耗材、环境污染严格防控的基础上,人体接触可能是造成污染的主要来源;同时,推测单染色体之所以扩增失败可能是因为染色体自身超螺旋状态造成引物难以结合和复制.该研究还针对存在的问题提出了可行性建议,为将来成功进行单染色体测序提供了有益的借鉴.