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基于CIBERSORT预测乳腺癌浸润性免疫细胞比例及亚型预后分析
基于CIBERSORT预测乳腺癌浸润性免疫细胞比例及亚型预后分析
作者:
余彩裙
裴晶晶
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
浸润性免疫细胞
反卷积
一致聚类
生存分析
摘要:
乳腺癌是目前女性最常见的癌症,在乳腺癌患者治疗的过程中,确定浸润性的免疫细胞比例最有可能成为药物的靶标来提高患者的生存率,对乳腺癌患者后续的治疗和预后分析具有重要的意义和价值.反卷积的目的就是试图从复杂组织中推断免疫细胞的比例信息,进而准确刻画肿瘤样本中免疫细胞的浸润情况.因此应用CIBERSORT反卷积算法预测不同免疫细胞在乳腺癌样本中所占的比例,基于此数据应用一致聚类分析对乳腺癌样本进行了亚型分类,最后根据分类的结果进行预后分析.结果表明不同的亚型对肿瘤预后存在着显著的差异(p值为0. 008 2,小于0. 05 ),应用CIBERSORT算法和一致聚类分析对患者进行预后分析具有一定的合理性,可为临床诊断及治疗提供一定的帮助.
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文献信息
篇名
基于CIBERSORT预测乳腺癌浸润性免疫细胞比例及亚型预后分析
来源期刊
云南民族大学学报(自然科学版)
学科
工学
关键词
浸润性免疫细胞
反卷积
一致聚类
生存分析
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
信息与计算机科学
研究方向
页码范围
78-83
页数
6页
分类号
Q812|TP183
字数
3623字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1672-8513.2020.01.012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
裴晶晶
云南民族大学数学与计算机科学学院
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余彩裙
云南民族大学数学与计算机科学学院
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引文网络
引文网络
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
浸润性免疫细胞
反卷积
一致聚类
生存分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
云南民族大学学报(自然科学版)
主办单位:
云南民族大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-8513
CN:
53-1192/N
开本:
大16开
出版地:
中国昆明市一二·一大街134号
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2286
总下载数(次)
5
总被引数(次)
8502
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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